Содержание
Ферменты - это белки, которые снижают энергию активации в химических реакциях и при этом не расходуются на реакцию. Биологически ферменты являются незаменимыми молекулами, которые ускоряют реакции в метаболических системах. В результате ферментативная кинетика изучает скорость реакции ферментов в различных химических условиях. Многие факторы влияют на скорость фермента. Концентрация субстрата, температура, ингибиторы и рН влияют на порог фермента в химической реакции. С помощью линейных отношений, таких как график Lineweaver-Burk, вы можете найти максимальную скорость фермента.
Простота расчета Vmax на графике Lineweaver-Burk
Начните с построения уравнения Михаэлиса-Ментена, чтобы получить кривую гиперболы. Затем используйте обратную величину уравнения Михаэлиса-Ментена для получения формы фермента с наклоном-перехватом. Далее вы получите скорость активности фермента как 1 / Vo = Km / Vmax (1 /) + 1 / Vmax, где Vo - начальная скорость, Km - константа диссоциации между субстратом и ферментом, Vmax - максимум скорость, а S - концентрация субстрата.
Поскольку уравнение наклона-пересечения связывает скорость с концентрацией субстрата, вы можете использовать типичную формулу y = mx + b, где y - зависимая переменная, m - наклон, x - независимая переменная, а b - у-перехват. Перед определенным компьютерным программным обеспечением вы бы использовали миллиметровку, чтобы нарисовать линию. Теперь вы используете типовое программное обеспечение базы данных для построения уравнения. Итак, зная начальную скорость, Vo и различную концентрацию субстрата, вы можете создать прямую линию. Линейный график представляет наклон Km / Vmax и y-пересечение 1 / Vmax. Затем используйте обратную величину y-перехвата для расчета Vmax активности фермента.
Использование для сюжета Lineweaver-Burk
Ингибиторы изменяют максимальную скорость активности фермента в основном двумя способами: конкурентным и неконкурентным. Конкурентный ингибитор связывается с сайтом активации фермента, блокирующего субстрат. Таким образом, ингибитор конкурирует с субстратом за связывание с сайтом фермента. Допуская высокую концентрацию конкурентного ингибитора, обеспечивает связывание с сайтом. Следовательно, конкурентный ингибитор изменяет динамику ферментативной скорости.Во-первых, ингибитор изменяет уклон, а X-точка пересечения Km создает гораздо более крутой уклон. Однако максимальная скорость Vmax остается неизменной.
С другой стороны, неконкурентный ингибитор связывается с сайтом, отличным от сайта активации фермента, и не конкурирует с субстратом. Ингибитор модифицирует структурные компоненты сайта активации, предотвращая связывание субстрата или другой молекулы с сайтом. Это изменение влияет на сродство субстрата к ферменту. Неконкурентные ингибиторы изменяют наклон и y-точку пересечения графика Lineweaver-Burk, уменьшая Vmax и увеличивая y-точку пересечения с более крутым наклоном. Тем не менее, X-перехват остается прежним. Хотя сюжет Lineweaver-Burk полезен во многих отношениях, линейный сюжет имеет ограничения. К сожалению, график начинает искажать скорости при очень высоких или низких концентрациях субстрата, создавая экстраполяции на графике.